Informe de Resultados Red Multiambiental de Evaluación de cultivares de Trigo

1 Introducción

El cultivo de trigo (Triticum aestivum) es una de las alternativas de utilización del suelo en la época invernal más comunes en la región. Su inclusión en la rotación, generalmente asociada con el cultivo de soja de segunda, genera un aporte de C al suelo y cobertura, disminuye la incidencia de enfermedades y plagas en otros cultivos.

El rendimiento de un cultivo (fenotipo) es función del resultado acumulativo de un número de factores que inciden en la interacción entre la expresión del material genético del cultivar o variedad (genotipo) y las condiciones en las cuales la planta crece (ambiente). Los ambientes difieren en la cantidad y calidad de recursos que están disponibles para las plantas (agua, nutrientes y radiación), y las plantas capturan y convierten dichos recursos en biomasa y órganos de interés comercial, según su carga genética, que a su vez es modulada por el ambiente (Yan y Kang, 2002).

Según el objetivo de mejoramiento, los genotipos pueden ser seleccionados para mejorar su adaptación a un amplio rango de condiciones ambientales o bien para condiciones más específicas. En este último caso, la adaptación sitio-específica de los genotipos se relaciona con el fenómeno denominado interacción genotipo-ambiente (GA), el cual se observa cuando la performance relativa de los fenotipos depende del ambiente en el que crecen (Malosetti et al., 2013).

La interacción GA reduce la asociación entre los valores fenotípicos y genotípicos, lo cual puede ocasionar que los genotipos seleccionados por su performance en un ambiente tengan mal desempeño en otro. Es por ello que en presencia de fuerte interacción GA, gran parte del éxito productivo del cultivo de trigo es el resultado de la elección de los materiales más aptos para cada ambiente.

1.1 Objetivos

  • Resumir los datos de rendimiento de los genotipos de trigo evaluadas en la Red CREA RNSF de Ensayos Multiambientales durante la campaña 2021/22.

  • Analizar estadísticamente los datos comparando los genotipos globalmente en toda la red en la campaña 2021/22.

  • Explorar y describir los patrones de la interacción GA en la campaña 2021/22 en particular y considerando el conjunto de ambientes explorados en las distintas localidades y campañas.

2 Metodología

2.1 Sitios experimentales

Durante la campaña 2021/22 se llevaron adelante ensayos comparativos de rendimiento de genotipos de trigo en 4 localidades del Norte de la Provincia de Santa Fe. Los sitios seleccionados para los ensayos en cada localidad corresponden a establecimientos productivos de miembros CREA de la Región Norte de Santa Fe. La distribución espacial e información de los ensayos se muestra en la Figura 2.1. A modo de referencia se incluye la ubicación de los ensayos de las campañas anteriores. Haciendo clik sobre los puntos de la campaña 2021/22 se muestran los datos de cada ensayo (Fecha de siembra, antecesor, densidad, fertilizacion, etc).

Figura 2.1: Distribución espacial de las localidades incluidas en la campaña 2021/22 y anteriores

En cada sitio se establecieron ensayos comparativos de rendimiento (ECR) utilizando un diseño experimental sin réplicas con controles sistemáticos (Kempton, 1997). Los materiales fueron sembrados con espaciamiento entre surco (EES) de 21 cm en franjas de entre 2.6 y 10.4 m de ancho por 110 y 340 m de longitud. En la localidad Siete Provincias la siembra con un espaciamiento entre surco de 52 cm. En todos los casos se utilizó maquinaria de los productores.

2.2 Genotipos

Los tratamientos evaluados en la campania 2021/22 fueron 33 genotipos. En la Tabla 2.1 se indican las localidades en las que fueron evaluados.

Tabla 2.1: Cultivares evaluadas y localidades en las que fueron incluidas
Semillero Genotipo Localidades
Ceres Pedro Gomez Cello Siete Provincias Vera y Pintado
ACA 602
ACA 604
ACA 917
BIOINTA 1006
GINGKO
ALAMO
SARANDI
JACARANDA
BUCK COLIHUE
BUCK CUMELEN
BUCK SAETA
DM AROMO
DM AUDAZ
DM CATALPA
DM CEIBO
DM ÑANDUBAY
DM PEHUEN
GYT 914
HO ATUEL
IS HORNERO
IS TERO
IS TORDO
KLEIN FAVORITO II
KLEIN LIEBRE
KLEIN NUTRIA
KLEIN POTRO
KLEIN SELENIO CL
MS INTA 415
MS INTA 817
BAGUET 450
BAGUET 550
BAGUET 620
PAMPERO

A excepción de HO ATUEL, GYT 914, y PAMPERO que solo estuvieron presente en la localidad de Pedro Gomez Cello y Vera y Pintado el resto de los genotipos estuvieron presentes en las 4 localidades. El cultivar KLEIN NUTRIA actuó como referencia o check y sensor ambiental, con más de una réplica por localidad.

Para el análisis global se utilizaron los datos de todos los genotipos con presentes en al menos tres localidades.

2.3 Análisis estadístico

2.3.1 Rendimientos testigos

La información proveniente de las franjas testigo repetidas se utilizó para evaluar la variación dentro de las localidades y la existencia de tendencia espacial de los rendimientos según su ubicación en el experimento. Para esto último, en cada localidad se ajustaron modelos lineales de los rendimientos en función del orden de la parcela:

\[ y_{i} = \beta_0 + \beta_1X_i + e_{i} \]

donde: \(y_{i}\) representa la respuesta del testigo en la parcela \(i\), \(X_i\) es el número de posición de la parcela en el experimento, y \(\beta_0\) y \(\beta_1\) coeficientes de regresión.

2.3.2 Estadísticas descriptivas

Se calcularon estadísticas de resumen y gráficos descriptivos por genotipo y localidad para la variable respuesta rendimiento seco, expresado en kg ha-1 con 13.5% de humedad. El promedio de cada genotipo en la red se calculó utilizando la siguiente expresión:

\[ \bar{y}_i = \dfrac{\sum y_{ij}}{n_i} \]

donde: \(\bar{y}_i\) es el rendimiento medio del genotipo \(i\), \(y_{ij}\) es el rendimiento del genotipo \(i\) en la localidad \(j\) y \(n_i\) es el número de localidades donde fue evaluado el genotipo \(i\). En aquellos casos donde se contó con más de una franja por localidad, los datos fueron promediados dentro de cada localidad. Así mismo el coeficiente de variación (\(CV\)) de cada genotipo en la red se calculó mediante la siguiente expresión:

\[ CV_{{y}_i} = \dfrac{s_{y_i}}{\bar{y}_i} \times 100 \]

donde: \(\bar{y}_i\) es el rendimiento medio del genotipo \(i\) y \(s_{y_{i}}\) es el desvío estándar de los rendimientos del genotipo \(i\) a través de las localidades:

\[ s_{y_i} = \sqrt{\dfrac{\sum \left(y_{ij} - \bar{y}_i \right)^2}{n_i -1}} \]

Cabe mencionar que el tamaño de la muestra de ambientes es pequeño lo cual hace que los promedios y estimaciones de la variabilidad de los rendimientos a través de los ambientes sean limitadas.

2.3.3 Diferencias de rendimiento

Para comparar y determinar las diferencias de respuesta de los materiales evaluados a nivel región se ajustó a los datos un modelo lineal mixto, i.e. con efectos fijos y aleatorios sobre el rendimiento medio global de la Red. Los genotipos fueron considerados efectos fijos y las localidades efectos aleatorios:

\[ y^*_{ij} = \mu + \tau_i + l_j + e_{ij} \]

donde: \(y^*_{ij}\) representa la respuesta del genotipo \(i\) sembrado en la localidad \(j\), corregido por efecto de la posición de la parcela en caso necesario; \(\mu\) es la media general de los ensayos de la red, \(\tau_i\) es efecto o diferencia del genotipo \(i\) respecto a la media general del ensayo, \(l_j\) el efecto de la localidad \(j\), y \(e_{ij}\) el error experimental asociado al genotipo \(i\) sembrado en la localidad \(j\). Se asume que \(l_j\) como \(e_{ij}\) son independientes y tienen distribución normal con media 0 y varianza \(\sigma^2_l\) y \(\sigma^2_e\).

Este modelo asume que los niveles de Localidad son una muestra aleatoria de las localidades de la Región Norte y permite realizar inferencia más amplia sobre la respuesta de los genotipos. Debido a que los testigos fueron las únicas variedades replicadas, la interacción Genotipo:Localidad representaría la heterogeneidad de dicho genotipo dentro de cada Localidad por lo tanto no fue estimada (Piepho et al., 2012).

Las diferencias de rendimiento entre genotipos se determinaron mediante la prueba de comparaciones múltiples de Tukey, considerando un nivel de significancia de 10%.

2.3.4 Análisis interacción genotipo x ambiente

Para explorar los patrones de interacción GA se utilizó el procedimiento de regresión sobre la media (Finlay y Wilkinson, 1963)

La heterogeneidad ambiental explorada por los genotipos considerados en la red se caracterizó mediante los rendimientos medios de cada Localidad. Esta covariable denominada Índice Ambiental (IA) fue utilizada para modelar la interacción GA a partir del siguiente modelo:

\[ y_{ij} = \mu_i + \beta_i X_j + e_{ij} \]

donde: \(y_{ij}\) es el rendimiento del genotipo \(i\) en el ambiente o localidad \(j\), \(\mu_i\) es la ordenada al origen de cada genotipo, \(X_j\) el índice ambiental de la localidad \(j\), y \(\beta_i\) la pendiente o sensibilidad del genotipo \(i\) a los cambios del IA.

Según este modelo, \(\mu_i\) representa el comportamiento de los genotipos en el ambiente promedio y los coeficientes \(\beta_i\) la sensibilidad de los Genotipos a la calidad del ambiente caracterizada por el rendimiento medio de la localidad. Entonces, si la interacción GA es significativa representa la heterogeneidad de respuestas, i.e. \(\beta\) distintos para los genotipos. El valor de \(\beta\) indica la sensibilidad el genotipo a los cambios de calidad del ambiente. Si \(\beta_i > 1\) indica que el genotipo \(i\) tiene una respuesta mayor al promedio (a mayor calidad ambiental, mayor rendimiento), en cambio si \(\beta_i < 1\), entonces el genotipo responde menos.

Para complementar este análisis, se realizó el mismo procedimiento combinando los datos de campañas anteriores. Sobre dicha base de datos se exploró la respuesta de los genotipos repetidos en las últimas tres campañas empleando la misma metodología.

Tabla 2.2: Frecuencia de ambientes en la que estuvo presente cada genotipo en las últimas tres campañas
Genotipo Número de ambientes
ACA 602 9
BAGUETTE 450 9
BUCK SAETA 9
DM AUDAZ 9
DM CEIBO 9
DM ÑANDUBAY 9
GINGKO 9
KLEIN NUTRIA 9
HO ATUEL 7
BAGUET 550 7
BUCK COLIHUE 7
KLEIN FAVORITO II 7
KLEIN POTRO 7
MS INTA 415 6
MS INTA 817 6
KLEIN TAURO 5
ACA 604 4
ACA 917 4
ALAMO 4
BAGUET 620 4
BIOINTA 1006 4
BUCK CUMELEN 4
DM AROMO 4
DM CATALPA 4
DM PEHUEN 4
IS HORNERO 4
IS TERO 4
IS TORDO 4
JACARANDA 4
KLEIN LIEBRE 4
KLEIN SELENIO CL 4
SARANDI 4
ACA 920 3
BUCK CAMBÁ 3
GUAYABO 3
MS 415 3
MS 817 3
RAGT QUIRIKO 3
DM ALGARROBO 2
DM FUSTE 2
KLEIN LANZA 2
KLEIN PROTEO 2
KLEIN RAYO 2
NOGAL 111 2
SY 300 2
GYT 914 2
PAMPERO 2
ACA 360 1

De los 48 genotipos evaluados durante las últimas tres campañas, solo 8 estuvieron presentes en los 9 ambientes. Estos genotipos fueron utilizados para el análisis. Si bien el criterio de inclusión reduce la cantidad de genotipos incluidos, se incrementa la potencia para detectar patrones de interacción.

2.4 Software

Los datos fueron procesados utilizando el software estadístico R versión 4.1 (R Core Team, 2021) y los paquetes nlme (Pinheiro et al., 2018), emmeans (Lenth, 2019), tidyverse (Wickham, 2017) y plotly (Sievert, 2020).

3 Resultados

3.1 Rendimiento testigo

En la Tabla 3.1 se muestran los rendimientos promedio por localidad de los genotipos utilizados como check o control.

Tabla 3.1: Rendimiento seco medio y coeficiente de variación por localidad de los genotipos utilizados como check
Localidad media CV
Ceres 2386 22
Pedro Gomez Cello 3593 9
Siete Provincias 2924 3
Vera y Pintado 2895 12

A excepción de la localidad Ceres, en el resto de las localidades la variabilidad observada en los controles repetidos fue baja indicando homogeneidad en las condiciones experimentales dentro de cada sitio.

El análisis de las parcelas testigo mostró que en las localidades no se observó un gradiente de rendimientos consistente en dirección al orden de las parcelas por lo que los rendimientos no fueron ajustados. Por otro lado, el stand de plantas en las localidades evaluadas mostró baja variación, con CV en torno al 10%.

3.2 Rendimientos por Localiad

La Figura 3.1 muestra los rendimientos medios por localidad y el rendimiento medio de la campaña con línea continua. Se puede hacer zoom o mostrar/ocultar los grupos de datos haciendo doble-click en la leyenda.

Figura 3.1: Rendimiento medio y desvío estándar por Localidad

Se observa menor rendimiento promedio en la localidad Ceres y rendimientos similares en el resto de las localidades. Asímismo, a excepción de Siete Provincias, donde las parcelas con checks mostraron rendimientos iguales o superiores al rendimiento promedio de la localidad, en el resto de los sitios los controlos tuvieron rendimientos en torno al promedio.

3.3 Rendimientos por Genotipo

En la Figura 3.2 se presentan los rendimientos medios y desviaciones estándar de los genotipos considerando la variabilidad entre localidades. En general todos los genotipos presentaron rendimientos medios entre 2500 y 3500 kg ha-1. La amplitud de las barras representan las diferencias de variabilidad entre los materiales.

Figura 3.2: Rendimientos medios y desvio estándar de los genotipos

En las Tablas 3.2 y 3.3 se presentan los rendimientos y \(CV\) por Genotipo y Localidad, expresados en kg/ha y base 100. Los colores de ambas tablas dividen el rango de valores observados en partes de igual número de observaciones (quintiles). A su vez, los genotipos se encuentran ordenados por el promedio general a través de las localidades.

3.3.1 Redimientos reales

Tabla 3.2: Rendimiento seco medio (kg/ha) y coeficiente de variación por genotipo y localidad
Genotipo Localidad Promedio CV
Ceres Pedro Gomez Cello Siete Provincias Vera y Pintado
GINGKO 2846 4155 3402 3264 3417 14
PAMPERO 3599 3186 3392 6
BIOINTA 1006 2862 3903 2975 3502 3310 13
HO ATUEL 3356 3190 3273 3
GYT 914 3469 2938 3204 8
MS INTA 817 2250 3934 3215 3317 3179 19
ALAMO 2837 3484 2992 3160 3118 8
BUCK COLIHUE 3552 3453 2257 2977 3060 17
IS TORDO 2359 3473 3178 3205 3054 14
KLEIN NUTRIA 2386 3593 2924 2895 2950 15
BUCK SAETA 2220 3457 2975 2931 2896 15
DM CATALPA 1895 3496 2965 3138 2874 21
SARANDI 2217 3030 2724 3452 2856 16
ACA 917 2383 3648 2570 2791 2848 17
DM AROMO 2235 2416 2972 3753 2844 21
ACA 604 1428 3306 3230 3271 2809 28
KLEIN POTRO 1782 3461 2740 3182 2791 23
DM PEHUEN 2217 3185 2737 3016 2789 13
IS TERO 1782 3652 2747 2880 2765 24
BAGUET 620 2242 3492 2068 2907 2677 21
BAGUET 450 1895 3009 2740 2931 2644 17
DM ÑANDUBAY 2250 3033 2503 2716 2626 11
DM AUDAZ 2210 3479 2320 2395 2601 20
DM CEIBO 1893 2432 3197 2775 2574 19
ACA 602 1782 2856 2724 2917 2570 18
KLEIN LIEBRE 2380 2555 2608 2726 2567 5
MS INTA 415 1407 3178 2743 2736 2516 26
BAGUET 550 1814 2730 2247 3260 2513 21
KLEIN FAVORITO II 2361 3013 2031 2633 2510 14
IS HORNERO 1341 3640 2731 2260 2493 33
BUCK CUMELEN 2364 2971 2234 2345 2478 12
KLEIN SELENIO CL 1887 2567 2234 2706 2348 13
JACARANDA 2367 2752 2076 1999 2298 13
Promedio 2181 3266 2702 2950 2813 16
CV 21 13 14 13 11 40
Min 1341 2416 2031 1999 2298 3
Max 3552 4155 3402 3753 3417 33
Los datos pueden descargarse del siguiente link medias_CV_reales.xlsx

La variabilidad dentro de cada localidad, la cual indica la dispersión de los rendimientos entre los genotipos, fue moderada a baja entre 10 y 21%. Del mismo modo, el nivel de variabilidad de los genotipos a través de los ambientes fue moderada, aproximadamente el 50% de los genotipos tuvo CV entre 13 y 21%

En general los genotipos con rendimientos medios en el quintil más alto fue consistente entre localidades, observándose algunas situaciones como HO_ATUEL y GYT 914 que tuvieron rendimientos en torno al promedio en las localidades evaluadas pero en la general se posicionaron en el quintil superior, ya que en las localidades con rendimientos en general menores no estuvieron representados.

3.3.2 Redimientos relativos

Tabla 3.3: Rendimiento seco medio (base 100) y coeficiente de variación por genotipo y localidad
Genotipo Localidad Promedio CV
Ceres Pedro Gomez Cello Siete Provincias Vera y Pintado
GINGKO 130 127 126 111 124 6
BIOINTA 1006 131 120 110 119 120 6
ALAMO 130 107 111 107 114 8
BUCK COLIHUE 163 106 84 101 114 26
MS INTA 817 103 120 119 112 114 6
IS TORDO 108 106 118 109 110 4
PAMPERO 110 108 109 1
KLEIN NUTRIA 109 110 108 98 106 5
HO ATUEL 103 108 106 2
BUCK SAETA 102 106 110 99 104 4
ACA 917 109 112 95 95 103 8
DM AROMO 102 74 110 127 103 19
SARANDI 102 93 101 117 103 8
GYT 914 106 100 103 3
DM CATALPA 87 107 110 106 102 9
DM PEHUEN 102 98 101 102 101 2
ACA 604 65 101 120 111 99 21
KLEIN POTRO 82 106 101 108 99 10
IS TERO 82 112 102 98 98 11
BAGUET 620 103 107 77 99 96 12
BAGUET 450 87 92 101 99 95 6
DM ÑANDUBAY 103 93 93 92 95 5
DM AUDAZ 101 107 86 81 94 11
KLEIN LIEBRE 109 78 97 92 94 12
DM CEIBO 87 74 118 94 93 17
ACA 602 82 87 101 99 92 9
KLEIN FAVORITO II 108 92 75 89 91 13
BAGUET 550 83 84 83 111 90 13
BUCK CUMELEN 108 91 83 79 90 12
MS INTA 415 64 97 102 93 89 17
IS HORNERO 61 111 101 77 88 22
KLEIN SELENIO CL 87 79 83 92 85 6
JACARANDA 109 84 77 68 84 18
Promedio 100 100 100 100 100 10
CV 21 13 14 13 10 63
Min 61 74 75 68 84 1
Max 163 127 126 127 124 26
Los datos pueden descargarse del siguiente link medias_CV_rel.xlsx

Al considerar los rendimientos en base 100 expresados sobre el promedio de cada localidad se remueve el efecto de la variación entre localidades. Se observa un reacomodamiento pero manteniendo a GINGKO y BIOINTA 1006 en los primeros lugares con vaores en promedio 20% superior a la media de las localidades. El genotipo BUCK COLIHUE mostró alto desemepeño global pero con valores de CV tres veces mayores.

3.4 Rendimientos promedio y CV

La Figura 3.3 presenta la relación entre los rendimientos medios y la estabilidad (indicada por el CV) de los genotipos a través de las localidades incluidas en la red durante la campaña 2021/22.

Figura 3.3: Rendimiento seco medio (en kg/ha) y CV (%) de los genotipos evaluados en la campaña 2021/22

Tomando el rendimiento y CV medios de la red (líneas punteadas), se observa que los genotipos con altos rendimientos promedio (GINKO, BIOINTA 1006) mostraron una variabilidad en torno al 15%, consistente con el promedio de variación de los materiales evaluados. Si bien los genotipos PAMPERO, HO ATUEL y GYT 914 mostraron rendimientos superiores al promedio y baja variabilidad, estas estimaciones se basan solo en 2 localidades.

Dentro del un segundo grupo con rendimientos similar al promedio general (~ 2800 kg/ha), se observa un grupo con CV en torno al promedio y otro grupo con valores de CV superiores a 23% (DM AROMO, DM CATALPA, KLEIN POTRO, IS TERO y ACA 604. Los genotipos restantes mostraron niveles de rendimiento menores y un rango de variabilidad de 6 a 38%.

3.5 Diferencias entre genotipos

En la Tabla 3.4 se presentan los resultados del análisis de la varianza (ANOVA) del modelo mixto ajustado:

Tabla 3.4: Tabla de Análisis de la Varianza del modelo lineal mixto
gl num gl den F Valor p
(Intercept) 1 87 152.04 0.00000
Genotipo 29 87 2.19 0.00274

Se detectaron diferencias de rendimiento estadísticamente significativas considerando la red en su conjunto y considerando la heterogeneidad de variabilidad entre localidades (p = 0.0027). En Tabla 3.5 se listan los valores medios ajustados, errores estándar e intervalos de confianza de los rendimientos medios de cada genotipo. La amplitud de los \(IC_{90}\) responde a que el espacio de inferencia es toda la región de donde proviene la muestra de las 4 localidades analizadas y la precisión alcanzada según el número de réplicas.

Tabla 3.5: Rendimientos intervalos de confianza 90% ajustados por el modelo-mixto
Rend. medio Error estándar gl LI IC90 LS IC90 grupo
GINGKO 3417 289 3 2736 4098 1
BIOINTA 1006 3310 289 3 2630 3991 1
MS INTA 817 3179 289 3 2498 3860 12
ALAMO 3118 289 3 2437 3799 12
BUCK COLIHUE 3060 289 3 2379 3741 12
IS TORDO 3054 289 3 2373 3735 12
KLEIN NUTRIA 2949 289 3 2269 3630 12
BUCK SAETA 2896 289 3 2215 3577 12
DM CATALPA 2873 289 3 2193 3554 12
SARANDI 2856 289 3 2175 3537 12
ACA 917 2848 289 3 2167 3529 12
DM AROMO 2844 289 3 2163 3525 12
ACA 604 2809 289 3 2128 3490 12
KLEIN POTRO 2791 289 3 2110 3472 12
DM PEHUEN 2789 289 3 2108 3470 12
IS TERO 2765 289 3 2084 3446 12
BAGUET 620 2677 289 3 1996 3358 12
BAGUET 450 2644 289 3 1963 3325 12
DM ÑANDUBAY 2625 289 3 1945 3306 12
DM AUDAZ 2601 289 3 1920 3282 12
DM CEIBO 2574 289 3 1893 3255 12
ACA 602 2570 289 3 1889 3251 12
KLEIN LIEBRE 2567 289 3 1886 3248 12
MS INTA 415 2516 289 3 1835 3197 12
BAGUET 550 2513 289 3 1832 3194 12
KLEIN FAVORITO II 2509 289 3 1829 3190 12
IS HORNERO 2493 289 3 1812 3174 12
BUCK CUMELEN 2478 289 3 1798 3159 12
KLEIN SELENIO CL 2348 289 3 1668 3029 2
JACARANDA 2298 289 3 1618 2979 2

En el cuadro anterior representa el ranking de genotipos ordeandos por el rendimiento global para la zona de influencia de la Red. El rendimiento medio representa la mejor estimación del rendimiento de cada genotipo para la región en general a partir de la información obtenida en el presente ensayo. Este valor estimado se acompaña de los límites de un intervalo de confianza (LI IC90 y LS IC90) los cuales representan la región donde se encuentra el verdadero valor del rendimiento.

Considerando la red globalmente, el ranking de materiales muestra diferencias entre GINKO y BIOINTA 1006 respecto de KLEIN SELENIO CL y JACARANDA.

3.6 Interacción GA

3.6.1 Campaña actual

Las diferencias de los rendimientos medios de cada localidad resumen la heterogeneidad de condiciones ambientales a las cuales fueron sometidos los genotipos evaluados. Utilizando esta información se construye un índice ambiental (IA) que se utiliza para modelar la interacción genotipo x ambiente a partir de rendimientos de cada genotipo y ambiente. En la Tabla 3.6 se presenta la tabla de ANOVA del modelo.

Tabla 3.6: Tabla de ANOVA del modelo de regresión para la interacción GxA
Fuente gl SC CM F Valor p
Localidad 3 19663946.95 6554648.98 49.04 <0.0001
Genotipo 32 9040858.88 282526.84 2.11 0.0066
Genotipo:IA 32 4304388.76 134512.15 1.01 0.4798
Residuals 58 7751747.28 133650.82

Según este análisis, no se detecta interacción significativa entre los materiales evaluados y el índice ambiental (p = 0.48). Esto implica que no se pudo dectectar la heterogeneidad entre los materiales en la relación a la sensibilidad, es decir la relación entre el IA y los rendimientos, posiblemente debido a la baja variabilidad de dicho indicador que fue en torno al ~ 14%. Los datos sugieren que hay variación en la norma de reacción de los genotipos respecto a la general, no obstante el rango de ambientes explorado hace que las diferencias no sean significativas estadísticamente.

En la Figura 3.4 se presentan las gráficas correspondientes a las normas de reacción a los cambios del IA en relación a la respuesta promedio (recta 1:1). Por defecto se muestra el primer genotipo, pero haciendo click o doble-click sobre los nombres de los genotipos se pueden agregar/remover rectas para comparar.

Figura 3.4: Respuesta diferencial de cada Genotipo a los cambios del IA

Las pendientes (\(\beta\)) de las rectas (línea sólida de color) representan la sensibilidad de cada genotipo a la calidad del ambiente caracterizada por el rendimiento medio de la localidad. La sensibilidad promedio (línea punteada) representa la respuesta general de todos los genotipos. Para un genotipo cualquiera, si el valor de la pendiente es \(\beta_i > 1\), el genotipo en cuestión tiene mayor sensibilidad a los cambios de calidad del ambiente (a mayor calidad ambiental, mayor rendimiento, y vice versa). En cambio si \(\beta_i < 1\), entonces el genotipo es menos sensible y tendría mejores respuestas en ambientes malos y respuestas inferiores al promedio en ambientes buenos. Las diferencias entre las pendientes de los distintos genotipos representa la interacción GA.

Figura 3.5: Coeficiente de sensibilidad vs rendimiento medio de los genotipos a través de las localidades

A modo descriptivo los valores estimados de los \(\beta\) para algunos genotipos, como por ejemplo IS HORNERO, ACA 604, IS TERO, MS INTA 415, KLEIN POTRO, MS INTA 817 y DM CATALPA que mostraron pendientes positivas 25% mayores al promedio general. En el otro extremo, BUCK COLIHUE, KLEIN LIEBRE, JACARANDA, BUCK CUMELEN, DM AROMO, DM CEIBO, ALAMO, KLEIN FAVORITO II, KLEIN SELENIO CL y DM ÑANDUBAY fueron los materiales con menor sensibilidad (pendientes 25% menores a 1)

3.6.2 Últimas tres campañas

Al considerar los ambientes evaluados en las últimas tres campañas (combinacion localidad x campaña), sólo 8 genotipos estuvieron presentes en los 9 ambientes explorados en las últimas tres campañas. En la Tabla 3.7 se presenta la tabla de ANOVA del modelo de regresión de la media ajustado.

Tabla 3.7: Tabla de ANOVA del modelo de regresión para la interacción GxA
Fuente gl SC CM F Valor p
Localidad 7 31992436.49 4570348.07 33.91 <0.0001
Genotipo 7 3259344.84 465620.69 3.45 0.0044
Genotipo:IA 8 3213520.01 401690.00 2.98 0.0084
Residuals 49 6604418.11 134784.04

Según este análisis se detecta interacción significativa entre los materiales evaluados y el índice ambiental (p = 0.0084). Esto implica que al menos uno de los genitipos mostró una norma de reacción con pendiente distinta de 1, es decir, sensibilidad diferente al promedio. La Table 3.8 muestra los valores de pendiente estimados.

Tabla 3.8: Penidentes estimadas últimas tres campañas
Genotipo Beta Error estándar gl LI IC95 LS IC95
ACA 602 0.61 0.19 56 0.23 0.98
BAGUETTE 450 1.18 0.19 56 0.80 1.55
BUCK SAETA 1.24 0.19 56 0.86 1.61
DM AUDAZ 1.26 0.19 56 0.88 1.63
DM CEIBO 0.80 0.19 56 0.43 1.18
DM ÑANDUBAY 1.05 0.19 56 0.68 1.43
GINGKO 1.03 0.19 56 0.66 1.41
KLEIN NUTRIA 0.90 0.19 56 0.53 1.27

Según la tabla anterior se observa que solamente el material ACA 602 tiene un valor de sensibilidad significativamente distinto (inferior) a la unidad, lo que implicaría una menor sensibilidad a los cambios del ambiente.

En la Figura 3.6 se presentan las gráficas correspondientes a las normas de reacción a los cambios del IA en relación a la respuesta promedio (recta 1:1). Por defecto se muestra el primer genotipo, pero haciendo click o doble-click sobre los nombres de los genotipos se pueden agregar/remover rectas para comparar.

Figura 3.6: Respuesta diferencial de cada Genotipo a los cambios del IA ultimas tres campañas

Según el gráfico anterior se observa la menor pendiente de ACA 602 así como también un mayor rendimiento medio de GINGKO siguiend el patrón de sensibilidad del promedio.

4 Consideraciones finales

En general se observó una moderada a baja variabilidad de los rendimientos de cada variedad a través de las distintas localidades evaluadas y baja heterogeneidad de respuesta dentro de cada localidad. A nivel global las diferencias se mayormente entre GINKO y KLEIN LIEBRE con rendimientos de ~ 100 kg superiores a KLEIN SELENIO CL y JACARANDA.

En el estudio de la interacción GA mediante el método de regresión no detectó diferencias significativas respecto al patrón de respuesta promedio cuando se consideró la campaña actual. No obstante, algunos genotipos mostraron patrones de reacción con marcada sensibilidad o estabilidad una tendencia mayor rensibilidad a variaciones del índice ambiental.

En el análisis combinado los datos de las últimas tres campañas se observó algunas diferencias significativas en los patrones siendo ACA 602 menos sensible que el promedio y GINGKO el de mayor rendimiento a través de los ambientes.

5 Agradecimientos

  • A las empresas semilleras: A.C.A., Bioceres, Bioseminis, Buck, Don Mario, GPS semillas, Horus, Illinois, Klein, MacroSeed, Nidera, y Santa Rosa, por haber confiado un año más en nuestra zona y en la utilidad de los Ensayos Comparativos de Rendimiento.

  • A las Empresas CREA de la Región Norte de Santa Fe que año tras año realizan el esfuerzo de siembra conducción y cosecha de estas macro parcelas en sus establecimientos, dedicando personal tiempo y recursos para tal fin.

6 Bibliografía

Finlay, K. W., and Wilkinson, G.N. (1963). The analysis of adaptation in a plant-breeding programme. Aust. J. Agric. Res. 14, 742–754.

Kempton, R.A. (Ed) (1997). Statistical methods for plant variety evaluation. Plant breeding series. Chapman & Hall, London. pp. 191.

Lenth, R. (2019). emmeans: Estimated Marginal Means, aka Least-Squares Means. R package version 1.3.3. https://CRAN.R-project.org/package=emmeans

Malosetti, Marcos, Jean-Marcel Ribaut, and Fred A. van Eeuwijk. 2013. “The Statistical Analysis of Multi-Environment Data: Modeling Genotype-by-Environment Interaction and Its Genetic Basis.” Frontiers in Physiology 4 (March). doi:10.3389/fphys.2013.00044.

Piepho, H.P., C. Richter, J. Spilke, K. Hartung, A. Kunick, and H. Thöle. 2011. Statistical aspects of on-farm experimentation. Crop and Pasture Science 62(9): 721.

Pinheiro J, Bates D, DebRoy S, Sarkar D, R Core Team (2018). nlme: Linear and Nonlinear Mixed Effects Models. R package version 3.1-137, URL: https://CRAN.R-project.org/package=nlme.

R Core Team (2021). R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. URL https://www.R-project.org/.

Sievert, C. (2020) Interactive Web-Based Data Visualization with R, plotly, and shiny. Chapman and Hall/CRC Florida.

Wickham, H. (2017). tidyverse: Easily Install and Load the ‘Tidyverse’. R package version 1.2.1. https://CRAN.R-project.org/package=tidyverse

Yan, W.; Kang, M. S. (2002). GGE Biplot Analysis: A Graphical Tool for Breeders, Geneticists, and Agronomists. 1st edition. CRC Press. pp. 288.